特殊工况下的废气具有成分复杂、浓度高、温度异常或含有特殊污染物等特点，对废气净化塔提出了严峻挑战，需针对性制定处理方案。
对于高温废气，如冶金、玻璃制造等行业产生的废气，温度可达数百度甚至更高。首先要进行降温预处理，采用间接冷却方式，如通过热交换器将高温废气的热量传递给冷水或空气，使其温度降低到适合后续净化处理的范围。然后根据废气成分，选择合适的净化塔。若废气中含有酸性气体，可采用耐高温材料制造的喷淋塔，在喷淋液中添加耐高温的中和剂，进行中和反应。对于含有机物的高温废气，可先通过吸附塔吸附有机物，吸附剂需选用耐高温型号，之后再进行后续处理。
高浓度有机废气常见于化工、涂装等行业，处理不当易引发安全事故。针对此类废气，采用吸附浓缩 - 催化燃烧联合工艺。先用活性炭吸附塔对高浓度有机废气进行吸附，使废气得到初步净化。当活性炭吸附饱和后，利用热空气脱附，将浓缩后的高浓度有机废气送入催化燃烧塔。在催化剂作用下，有机废气在较低温度下发生燃烧反应，转化为二氧化碳和水，实现高效净化，同时回收燃烧产生的热量用于脱附过程，降低能耗。
对于含有重金属的废气，如电子垃圾处理、有色金属冶炼产生的废气，处理方案侧重于重金属的捕集与回收。利用特制的吸附剂，如对重金属有高亲和力的离子交换树脂或改性活性炭，通过吸附塔吸附废气中的重金属颗粒。吸附后的吸附剂可通过化学洗脱等方法回收重金属，实现资源再利用。同时，为防止吸附剂中毒，需对废气进行预处理，去除可能影响吸附效果的杂质。
当废气中含有高浓度粉尘时，如矿山开采、水泥生产产生的废气，首先采用高效除尘设备，如旋风除尘器、布袋除尘器等，去除大部分粉尘。然后再将剩余含尘废气送入净化塔进行进一步处理。净化塔内部结构需进行特殊设计，防止粉尘堆积堵塞，例如采用大孔径填料、优化气流分布方式等，确保净化塔在高粉尘工况下稳定运行。针对特殊工况废气的处理方案，需综合考虑废气特性，合理组合净化技术与设备，实现高效、安全、环保的废气治理目标。
